江戸川コナン

『名探偵コナン』の主人公。黒ずくめの組織に飲まされた毒薬の副作用で身体が縮み、正体を隠して毛利探偵事務所に居候しながら難事件を解決する。天才的な推理力と冷静沈着な判断力を持ち、危機的状況でも論理的に行動する。一方で、恋人の毛利蘭への想いが行動原理の核となっている。

工藤新一

『名探偵コナン』の主人公・江戸川コナンの正体。頭脳明晰で容姿端麗な高校生探偵。「何かと理由を探し、矛盾をなくすように考える理論派」と評される徹底した論理型思考の持ち主。数々の難事件を解決し、「東の高校生探偵」「日本警察の救世主」などと称される天才的推理力で知られる。黒ずくめの組織に薬を盛られ幼児化した後も、コナンとして活躍を続ける。

灰原哀

元黒ずくめの組織の科学者で、本名は宮野志保。開発していた毒薬APTX4869を自ら服用し幼児化した後、阿笠博士に保護され灰原哀として生活している。優れた分析力と冷静な判断力を持つが、組織に追われる恐怖や姉を失った悲しみを抱えながらも、徐々に少年探偵団のメンバーとの絆を深めていくキーパーソン。

吉田歩美

『名探偵コナン』に登場する少年探偵団のメンバー。好奇心旺盛で素直かつ純情な性格であり、コナンに片想いしている。動物好きで天然な一面を持ち、他人の感情や恋愛に敏感である。

円谷光彦

『名探偵コナン』に登場する少年探偵団のメンバー。帝丹小学校1年B組在籍。誰にでも敬語を使い、礼儀正しく博学な頭脳派。小学1年生としては驚異的な知識量と推理力を持ち、時にコナンや灰原も感心する。またバイリンガルであり、投擲術にも長けるなど多彩な才能を持つ。

小嶋元太

『名探偵コナン』に登場する少年探偵団のメンバー。帝丹小学校1年B組に在籍する小学生で、肥満気味の体型とおにぎりのような頭が特徴。自称団長だが実質的なリーダーは江戸川コナン。直情的かつ短気で思ったことがすぐ顔に出る性格だが、正義感が強く、大食いで特にうな重が大好物。

目暮十三

警視庁捜査一課の警部。太い口髭と絶対に脱がない帽子がトレードマーク。その帽子の下には、妻・みどりとの馴れ初めの場で負った傷跡が隠されている。原作・アニメ共に第1話から登場する最古参キャラの一人で、毛利小五郎のかつての上司。正義感が非常に強く、犯罪者を絶対悪と見なす厳格な性格だが、部下からの信頼は厚く、佐藤美和子からは父親のように慕われている。

佐藤美和子

警視庁捜査一課の刑事で、警部補。28歳。警視庁のマドンナ的存在であり、男勝りで行動力がありながらもナイーブな一面を持つ。高木刑事との恋愛関係や、父の形見であるRX-7を愛車とするなど、人間味あふれるキャラクターとして描かれている。

高木渉

警視庁捜査一課の刑事（巡査部長）。温和で誠実な性格で、先輩刑事の佐藤美和子と恋人関係にある。かつての指導役・伊達航の遺志を受け継ぎ、彼の遺した手帳を形見として大切に持ち歩く。コナンたち少年探偵団とも親しく、時に彼らの保護者的な役割を果たす。劇場版『ハロウィンの花嫁』では佐藤へのプロポーズを果たした。

白鳥任三郎

警視庁捜査一課に所属するキャリア組の刑事。階級は警部。建築、ワイン、絵画などに造詣が深い上品な性格であり、初期は佐藤美和子に恋心を抱いていたが、後に初恋の相手である小林澄子と結ばれる。正義感が強く、刑事としての誇りを持ちながらも、恋愛面では一途で誠実な一面を持つ。

小林澄子

『名探偵コナン』の登場人物で、帝丹小学校1年B組の担任教師。26歳。赴任当初は生徒に厳しく接していたが、本当は子供好きで優しい性格。コナンの助言で本来の自分を取り戻し、少年探偵団の顧問を自称する。正義感が強く女刑事に憧れており、白鳥警部とは恋人同士。

ベルモット

黒ずくめの組織の女幹部。「千の顔を持つ魔女」の異名を持つ変装の達人で、組織のボス「あの方」から絶大な信頼を寄せられるミステリアスな存在。表の顔は大女優シャロン・ヴィンヤードとその娘クリスを演じ分ける一人二役であり、実年齢不詳。工藤新一（コナン）を「シルバーブレット」、毛利蘭を「エンジェル」と呼び、二人の正体を知りながら組織に報告せず密かに見守る。

秘密主義を体現する座右の銘「A secret makes a woman woman」は、彼女の複雑な内面を象徴している。

安室透

漫画『名探偵コナン』の登場人物。喫茶店ポアロのアルバイト店員、私立探偵、毛利小五郎の弟子という表向きの顔を持つ。その正体は警察庁警備局警備企画課の公安警察官・降谷零であり、さらに黒ずくめの組織に潜入するコードネーム「バーボン」という、トリプルフェイスを持つ男。洞察力や観察力に優れ、多岐にわたるスキルを駆使する切れ者。

水無怜奈

日売テレビの人気アナウンサーとして活動する一方、黒ずくめの組織に潜入するCIA諜報員。父親の死を乗り越え、組織とFBIの二重スパイとして危険な任務を遂行する。冷静沈着で任務に対する責任感が強く、潜入工作員としての高い能力を持つ。

宮野志保

名探偵コナンの登場人物で、灰原哀の本当の姿。黒ずくめの組織の元メンバーで、コードネームはシェリー。組織でAPTX4869を開発した天才科学者。姉・明美を組織に殺されたことを機に反抗し、自らAPTX4869を服用して幼児化し、組織から脱走。現在は灰原哀として阿笠博士に保護され、江戸川コナンと共に生活している。

ジン

黒ずくめの組織の幹部で、江戸川コナン（工藤新一）最大の宿敵。新一にAPTX4869を飲ませた張本人であり、組織の実行部隊の冷酷無情なリーダー。「疑わしきは罰せよ」を信条に、高い戦闘能力と推理力でコナンやFBIを追い詰める。組織への忠誠心はズバ抜けて強い。

ウォッカ

黒ずくめの組織の幹部で、ジンの相棒。がっしりした体格にサングラスが特徴。ジンを「兄貴」と呼び忠実にサポートする一方、ITスキルや車・バイク・ヘリの操縦など実務能力に長ける。機転のきかなさや注意力不足による迂闊なミスが目立つ「ポンコツ」な一面も持つ。